Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3DO95025 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3DO95025 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3DO95025 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3DO95025 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3DO95025 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3DO95025 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3DO95025 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3DO95025 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3DO95025 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3DO95025 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3DO95025 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3DO95025 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3DO95025 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3DO95025 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3DO95025 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3DO95025 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3DO95025 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3DO95025 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3DO95025 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3DO95025 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3DO95025 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3DO95025 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3DO95025 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3DO95025 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3DO95025 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3DO95025 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3DO95025 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEMA3DO95025 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3DO95025 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3DO95025 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3DO95025 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3DO95025 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3DO95025 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3DO95025 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3DO95025 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3DO95025 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3DO95025 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3DO95025 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3DO95025 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3DO95025 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3DO95025 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3DO95025 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3DO95025 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms