Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMCC1O94876 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMCC1O94876 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMCC1O94876 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMCC1O94876 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMCC1O94876 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMCC1O94876 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMCC1O94876 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMCC1O94876 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMCC1O94876 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMCC1O94876 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMCC1O94876 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMCC1O94876 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMCC1O94876 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMCC1O94876 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMCC1O94876 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMCC1O94876 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMCC1O94876 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMCC1O94876 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMCC1O94876 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCC1O94876 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCC1O94876 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCC1O94876 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCC1O94876 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCC1O94876 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMCC1O94876 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMCC1O94876 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMCC1O94876 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMCC1O94876 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMCC1O94876 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms