Protein–RNA interactions for Protein: O76064

RNF8, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF8O76064 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF8O76064 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF8O76064 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF8O76064 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF8O76064 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF8O76064 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF8O76064 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF8O76064 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF8O76064 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF8O76064 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF8O76064 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF8O76064 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF8O76064 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RNF8O76064 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF8O76064 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF8O76064 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF8O76064 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF8O76064 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF8O76064 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF8O76064 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF8O76064 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF8O76064 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF8O76064 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF8O76064 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF8O76064 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF8O76064 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF8O76064 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF8O76064 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF8O76064 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF8O76064 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF8O76064 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF8O76064 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF8O76064 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF8O76064 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF8O76064 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF8O76064 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF8O76064 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF8O76064 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF8O76064 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF8O76064 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF8O76064 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF8O76064 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF8O76064 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF8O76064 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF8O76064 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF8O76064 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF8O76064 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF8O76064 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF8O76064 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF8O76064 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF8O76064 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF8O76064 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF8O76064 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF8O76064 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF8O76064 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF8O76064 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF8O76064 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF8O76064 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF8O76064 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF8O76064 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF8O76064 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF8O76064 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF8O76064 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF8O76064 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF8O76064 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF8O76064 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF8O76064 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF8O76064 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF8O76064 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF8O76064 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF8O76064 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF8O76064 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF8O76064 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF8O76064 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF8O76064 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF8O76064 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF8O76064 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF8O76064 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF8O76064 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF8O76064 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF8O76064 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF8O76064 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF8O76064 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF8O76064 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF8O76064 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF8O76064 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF8O76064 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF8O76064 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF8O76064 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF8O76064 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF8O76064 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF8O76064 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RNF8O76064 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF8O76064 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF8O76064 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF8O76064 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF8O76064 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF8O76064 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF8O76064 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RNF8O76064 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms