Protein–RNA interactions for Protein: O75900

MMP23A, Matrix metalloproteinase-23, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP23AO75900 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP23AO75900 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP23AO75900 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP23AO75900 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP23AO75900 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP23AO75900 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP23AO75900 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP23AO75900 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP23AO75900 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP23AO75900 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP23AO75900 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP23AO75900 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP23AO75900 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP23AO75900 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MMP23AO75900 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MMP23AO75900 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MMP23AO75900 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MMP23AO75900 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MMP23AO75900 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MMP23AO75900 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MMP23AO75900 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MMP23AO75900 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MMP23AO75900 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MMP23AO75900 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP23AO75900 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP23AO75900 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP23AO75900 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP23AO75900 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP23AO75900 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP23AO75900 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MMP23AO75900 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MMP23AO75900 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MMP23AO75900 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MMP23AO75900 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MMP23AO75900 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MMP23AO75900 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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