Protein–RNA interactions for Protein: O75888

TNFSF13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13O75888 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFSF13O75888 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF13O75888 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFSF13O75888 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13O75888 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13O75888 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF13O75888 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13O75888 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13O75888 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF13O75888 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF13O75888 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF13O75888 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF13O75888 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF13O75888 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF13O75888 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF13O75888 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF13O75888 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF13O75888 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF13O75888 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF13O75888 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms