Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG13O75143 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG13O75143 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG13O75143 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG13O75143 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG13O75143 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG13O75143 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG13O75143 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG13O75143 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG13O75143 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG13O75143 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG13O75143 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG13O75143 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG13O75143 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG13O75143 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG13O75143 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG13O75143 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG13O75143 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG13O75143 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG13O75143 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG13O75143 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG13O75143 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG13O75143 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG13O75143 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG13O75143 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG13O75143 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG13O75143 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG13O75143 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG13O75143 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG13O75143 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG13O75143 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG13O75143 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG13O75143 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG13O75143 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG13O75143 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG13O75143 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG13O75143 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG13O75143 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG13O75143 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG13O75143 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG13O75143 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG13O75143 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG13O75143 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG13O75143 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG13O75143 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG13O75143 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG13O75143 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG13O75143 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG13O75143 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG13O75143 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG13O75143 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG13O75143 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG13O75143 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG13O75143 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG13O75143 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG13O75143 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG13O75143 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG13O75143 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG13O75143 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG13O75143 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG13O75143 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG13O75143 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG13O75143 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG13O75143 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG13O75143 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG13O75143 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG13O75143 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG13O75143 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG13O75143 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG13O75143 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG13O75143 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG13O75143 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATG13O75143 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG13O75143 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG13O75143 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG13O75143 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG13O75143 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG13O75143 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG13O75143 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG13O75143 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG13O75143 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG13O75143 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG13O75143 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG13O75143 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG13O75143 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG13O75143 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG13O75143 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG13O75143 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG13O75143 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG13O75143 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG13O75143 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG13O75143 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG13O75143 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG13O75143 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG13O75143 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATG13O75143 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG13O75143 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG13O75143 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATG13O75143 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG13O75143 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms