Protein–RNA interactions for Protein: O60671

RAD1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD1O60671 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD1O60671 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD1O60671 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD1O60671 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD1O60671 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD1O60671 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD1O60671 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD1O60671 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD1O60671 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD1O60671 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD1O60671 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD1O60671 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD1O60671 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD1O60671 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD1O60671 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD1O60671 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD1O60671 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD1O60671 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAD1O60671 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD1O60671 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD1O60671 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD1O60671 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD1O60671 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD1O60671 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD1O60671 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD1O60671 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD1O60671 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD1O60671 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD1O60671 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD1O60671 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD1O60671 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD1O60671 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD1O60671 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD1O60671 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD1O60671 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD1O60671 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD1O60671 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD1O60671 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD1O60671 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD1O60671 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD1O60671 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD1O60671 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD1O60671 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD1O60671 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD1O60671 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD1O60671 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD1O60671 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD1O60671 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD1O60671 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD1O60671 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD1O60671 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD1O60671 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD1O60671 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD1O60671 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD1O60671 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD1O60671 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD1O60671 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD1O60671 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD1O60671 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD1O60671 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD1O60671 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD1O60671 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD1O60671 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD1O60671 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD1O60671 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD1O60671 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD1O60671 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD1O60671 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD1O60671 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD1O60671 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD1O60671 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD1O60671 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD1O60671 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD1O60671 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD1O60671 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD1O60671 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD1O60671 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD1O60671 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD1O60671 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD1O60671 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD1O60671 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD1O60671 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD1O60671 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD1O60671 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD1O60671 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD1O60671 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD1O60671 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD1O60671 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD1O60671 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD1O60671 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD1O60671 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD1O60671 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD1O60671 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD1O60671 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD1O60671 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD1O60671 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD1O60671 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD1O60671 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD1O60671 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD1O60671 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms