Protein–RNA interactions for Protein: O43676

NDUFB3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB3O43676 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFB3O43676 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB3O43676 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB3O43676 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFB3O43676 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB3O43676 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB3O43676 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB3O43676 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB3O43676 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB3O43676 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB3O43676 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB3O43676 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB3O43676 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB3O43676 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFB3O43676 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms