Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC3O43617 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC3O43617 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC3O43617 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC3O43617 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC3O43617 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC3O43617 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC3O43617 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRAPPC3O43617 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC3O43617 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC3O43617 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC3O43617 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC3O43617 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC3O43617 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC3O43617 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC3O43617 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC3O43617 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC3O43617 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC3O43617 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC3O43617 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3O43617 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3O43617 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3O43617 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC3O43617 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC3O43617 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC3O43617 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC3O43617 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC3O43617 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC3O43617 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC3O43617 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC3O43617 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC3O43617 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC3O43617 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC3O43617 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC3O43617 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC3O43617 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC3O43617 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC3O43617 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC3O43617 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC3O43617 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC3O43617 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC3O43617 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC3O43617 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC3O43617 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC3O43617 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC3O43617 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3O43617 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3O43617 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC3O43617 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC3O43617 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC3O43617 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC3O43617 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC3O43617 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC3O43617 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC3O43617 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC3O43617 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC3O43617 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC3O43617 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms