Protein–RNA interactions for Protein: O15523

DDX3Y, ATP-dependent RNA helicase DDX3Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3YO15523 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX3YO15523 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX3YO15523 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX3YO15523 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX3YO15523 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX3YO15523 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX3YO15523 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX3YO15523 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX3YO15523 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX3YO15523 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX3YO15523 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX3YO15523 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX3YO15523 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX3YO15523 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX3YO15523 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX3YO15523 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX3YO15523 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX3YO15523 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX3YO15523 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX3YO15523 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX3YO15523 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX3YO15523 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX3YO15523 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX3YO15523 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX3YO15523 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX3YO15523 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX3YO15523 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX3YO15523 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX3YO15523 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX3YO15523 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX3YO15523 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX3YO15523 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX3YO15523 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX3YO15523 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX3YO15523 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX3YO15523 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX3YO15523 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX3YO15523 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX3YO15523 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX3YO15523 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX3YO15523 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX3YO15523 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX3YO15523 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX3YO15523 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX3YO15523 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX3YO15523 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX3YO15523 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX3YO15523 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX3YO15523 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX3YO15523 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX3YO15523 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX3YO15523 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX3YO15523 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX3YO15523 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX3YO15523 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX3YO15523 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX3YO15523 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX3YO15523 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX3YO15523 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX3YO15523 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX3YO15523 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX3YO15523 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX3YO15523 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX3YO15523 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX3YO15523 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX3YO15523 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX3YO15523 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX3YO15523 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX3YO15523 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX3YO15523 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX3YO15523 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX3YO15523 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX3YO15523 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX3YO15523 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX3YO15523 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX3YO15523 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX3YO15523 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX3YO15523 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX3YO15523 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX3YO15523 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX3YO15523 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX3YO15523 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms