Protein–RNA interactions for Protein: O15393

TMPRSS2, Transmembrane protease serine 2, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS2O15393 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS2O15393 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS2O15393 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS2O15393 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS2O15393 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS2O15393 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms