Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PFDN6O15212 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PFDN6O15212 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PFDN6O15212 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PFDN6O15212 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PFDN6O15212 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PFDN6O15212 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PFDN6O15212 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PFDN6O15212 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PFDN6O15212 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PFDN6O15212 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PFDN6O15212 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PFDN6O15212 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PFDN6O15212 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PFDN6O15212 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PFDN6O15212 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PFDN6O15212 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PFDN6O15212 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PFDN6O15212 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PFDN6O15212 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PFDN6O15212 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PFDN6O15212 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PFDN6O15212 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PFDN6O15212 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PFDN6O15212 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PFDN6O15212 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PFDN6O15212 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PFDN6O15212 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PFDN6O15212 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PFDN6O15212 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PFDN6O15212 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PFDN6O15212 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PFDN6O15212 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PFDN6O15212 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PFDN6O15212 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PFDN6O15212 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PFDN6O15212 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PFDN6O15212 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PFDN6O15212 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PFDN6O15212 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PFDN6O15212 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PFDN6O15212 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PFDN6O15212 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PFDN6O15212 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PFDN6O15212 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PFDN6O15212 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PFDN6O15212 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PFDN6O15212 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PFDN6O15212 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms