Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms