Protein–RNA interactions for Protein: O00178

GTPBP1, GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1O00178 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP1O00178 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP1O00178 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP1O00178 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GTPBP1O00178 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTPBP1O00178 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTPBP1O00178 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTPBP1O00178 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTPBP1O00178 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTPBP1O00178 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP1O00178 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP1O00178 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP1O00178 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP1O00178 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP1O00178 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTPBP1O00178 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP1O00178 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP1O00178 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP1O00178 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP1O00178 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP1O00178 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP1O00178 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP1O00178 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP1O00178 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP1O00178 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP1O00178 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP1O00178 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP1O00178 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTPBP1O00178 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP1O00178 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP1O00178 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP1O00178 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP1O00178 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP1O00178 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP1O00178 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP1O00178 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP1O00178 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP1O00178 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP1O00178 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP1O00178 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP1O00178 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP1O00178 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP1O00178 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GTPBP1O00178 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTPBP1O00178 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms