Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KT08 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KT08 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KT08 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KT08 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KT08 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KT08 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KT08 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KT08 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KT08 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KT08 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KT08 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KT08 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KT08 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3KT08 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KT08 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KT08 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KT08 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3KT08 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KT08 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KT08 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3KT08 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KT08 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KT08 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KT08 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KT08 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KT08 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KT08 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KT08 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KT08 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KT08 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KT08 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KT08 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KT08 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KT08 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KT08 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KT08 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KT08 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KT08 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KT08 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KT08 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KT08 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KT08 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KT08 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KT08 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KT08 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KT08 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KT08 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KT08 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KT08 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KT08 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KT08 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KT08 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KT08 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3KT08 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3KT08 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3KT08 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3KT08 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3KT08 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3KT08 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3KT08 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3KT08 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3KT08 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3KT08 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3KT08 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3KT08 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3KT08 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3KT08 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
J3KT08 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3KT08 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3KT08 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3KT08 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3KT08 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3KT08 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3KT08 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3KT08 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3KT08 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3KT08 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3KT08 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3KT08 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3KT08 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3KT08 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3KT08 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KT08 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KT08 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KT08 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KT08 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KT08 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KT08 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KT08 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KT08 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KT08 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KT08 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KT08 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KT08 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3KT08 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3KT08 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3KT08 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3KT08 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KT08 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms