Protein–RNA interactions for Protein: H3BQZ7

HNRNPUL2-BSCL2, HCG2044799, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC42.56■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.54■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.47■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC42.39■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC42.21■■■■■ 4.35
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms