Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IQCJ-SCHIP1C9J366 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IQCJ-SCHIP1C9J366 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IQCJ-SCHIP1C9J366 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IQCJ-SCHIP1C9J366 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IQCJ-SCHIP1C9J366 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IQCJ-SCHIP1C9J366 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IQCJ-SCHIP1C9J366 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IQCJ-SCHIP1C9J366 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IQCJ-SCHIP1C9J366 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms