Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM1B2RUZ4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM1B2RUZ4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM1B2RUZ4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM1B2RUZ4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM1B2RUZ4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM1B2RUZ4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM1B2RUZ4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM1B2RUZ4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM1B2RUZ4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM1B2RUZ4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM1B2RUZ4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM1B2RUZ4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM1B2RUZ4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM1B2RUZ4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms