Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF839A8K0R7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF839A8K0R7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF839A8K0R7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF839A8K0R7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF839A8K0R7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF839A8K0R7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF839A8K0R7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF839A8K0R7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF839A8K0R7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF839A8K0R7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF839A8K0R7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF839A8K0R7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF839A8K0R7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF839A8K0R7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF839A8K0R7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF839A8K0R7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF839A8K0R7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF839A8K0R7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF839A8K0R7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF839A8K0R7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF839A8K0R7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ZNF839A8K0R7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms