Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A6NL46 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A6NL46 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A6NL46 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A6NL46 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A6NL46 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A6NL46 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A6NL46 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A6NL46 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A6NL46 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A6NL46 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A6NL46 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A6NL46 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A6NL46 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A6NL46 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
A6NL46 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A6NL46 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NL46 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NL46 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NL46 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NL46 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NL46 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A6NL46 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A6NL46 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
A6NL46 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A6NL46 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A6NL46 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A6NL46 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A6NL46 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A6NL46 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A6NL46 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A6NL46 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A6NL46 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NL46 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A6NL46 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A6NL46 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A6NL46 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NL46 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NL46 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NL46 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NL46 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NL46 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NL46 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NL46 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NL46 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NL46 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NL46 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NL46 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A6NL46 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A6NL46 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A6NL46 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NL46 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NL46 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A6NL46 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A6NL46 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A6NL46 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A6NL46 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A6NL46 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A6NL46 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A6NL46 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
A6NL46 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
A6NL46 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A6NL46 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A6NL46 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A6NL46 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A6NL46 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A6NL46 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A6NL46 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A6NL46 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A6NL46 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
A6NL46 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
A6NL46 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A6NL46 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A6NL46 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A6NL46 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A6NL46 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A6NL46 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A6NL46 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A6NL46 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A6NL46 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A6NL46 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A6NL46 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A6NL46 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A6NL46 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A6NL46 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A6NL46 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A6NL46 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A6NL46 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A6NL46 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A6NL46 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A6NL46 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A6NL46 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A6NL46 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A6NL46 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A6NL46 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A6NL46 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A6NL46 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A6NL46 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A6NL46 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A6NL46 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms