Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NIN4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NIN4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NIN4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NIN4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NIN4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NIN4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NIN4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NIN4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A6NIN4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NIN4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NIN4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NIN4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NIN4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NIN4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NIN4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NIN4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NIN4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NIN4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NIN4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NIN4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NIN4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NIN4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NIN4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NIN4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NIN4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
A6NIN4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NIN4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NIN4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NIN4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NIN4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NIN4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NIN4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NIN4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NIN4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NIN4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NIN4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NIN4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NIN4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NIN4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NIN4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NIN4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NIN4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NIN4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NIN4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NIN4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NIN4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NIN4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NIN4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NIN4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NIN4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NIN4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NIN4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NIN4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NIN4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NIN4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NIN4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NIN4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NIN4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NIN4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6NIN4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6NIN4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6NIN4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NIN4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NIN4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NIN4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NIN4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NIN4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NIN4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NIN4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NIN4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NIN4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A6NIN4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A6NIN4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A6NIN4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A6NIN4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A6NIN4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A6NIN4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A6NIN4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A6NIN4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A6NIN4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A6NIN4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A6NIN4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A6NIN4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A6NIN4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A6NIN4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
A6NIN4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A6NIN4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A6NIN4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A6NIN4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A6NIN4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A6NIN4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A6NIN4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A6NIN4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A6NIN4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A6NIN4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A6NIN4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A6NIN4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A6NIN4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A6NIN4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms