Protein–RNA interactions for Protein: A6NGA9

TMEM202, Transmembrane protein 202, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM202A6NGA9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM202A6NGA9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM202A6NGA9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM202A6NGA9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM202A6NGA9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM202A6NGA9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM202A6NGA9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM202A6NGA9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM202A6NGA9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM202A6NGA9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM202A6NGA9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM202A6NGA9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM202A6NGA9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM202A6NGA9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM202A6NGA9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM202A6NGA9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM202A6NGA9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM202A6NGA9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM202A6NGA9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM202A6NGA9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM202A6NGA9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM202A6NGA9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM202A6NGA9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM202A6NGA9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM202A6NGA9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM202A6NGA9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM202A6NGA9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM202A6NGA9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM202A6NGA9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM202A6NGA9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM202A6NGA9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM202A6NGA9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM202A6NGA9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM202A6NGA9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM202A6NGA9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM202A6NGA9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM202A6NGA9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM202A6NGA9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM202A6NGA9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM202A6NGA9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms