Protein–RNA interactions for Protein: A6NFF2

NAP1L6, Putative nucleosome assembly protein 1-like 6, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L6A6NFF2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L6A6NFF2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L6A6NFF2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L6A6NFF2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L6A6NFF2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L6A6NFF2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L6A6NFF2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L6A6NFF2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L6A6NFF2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L6A6NFF2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAP1L6A6NFF2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAP1L6A6NFF2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAP1L6A6NFF2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAP1L6A6NFF2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAP1L6A6NFF2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L6A6NFF2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L6A6NFF2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L6A6NFF2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L6A6NFF2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L6A6NFF2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L6A6NFF2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L6A6NFF2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NAP1L6A6NFF2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NAP1L6A6NFF2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NAP1L6A6NFF2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NAP1L6A6NFF2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L6A6NFF2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NAP1L6A6NFF2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L6A6NFF2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L6A6NFF2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L6A6NFF2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L6A6NFF2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L6A6NFF2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L6A6NFF2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L6A6NFF2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L6A6NFF2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L6A6NFF2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L6A6NFF2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L6A6NFF2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L6A6NFF2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAP1L6A6NFF2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAP1L6A6NFF2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAP1L6A6NFF2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAP1L6A6NFF2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAP1L6A6NFF2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L6A6NFF2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L6A6NFF2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L6A6NFF2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L6A6NFF2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms