Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GOLGA6L4A6NEF3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GOLGA6L4A6NEF3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA6L4A6NEF3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA6L4A6NEF3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA6L4A6NEF3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA6L4A6NEF3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA6L4A6NEF3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA6L4A6NEF3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA6L4A6NEF3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA6L4A6NEF3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA6L4A6NEF3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA6L4A6NEF3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA6L4A6NEF3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GOLGA6L4A6NEF3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GOLGA6L4A6NEF3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GOLGA6L4A6NEF3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GOLGA6L4A6NEF3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA6L4A6NEF3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA6L4A6NEF3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA6L4A6NEF3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA6L4A6NEF3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA6L4A6NEF3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA6L4A6NEF3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA6L4A6NEF3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA6L4A6NEF3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GOLGA6L4A6NEF3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GOLGA6L4A6NEF3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GOLGA6L4A6NEF3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GOLGA6L4A6NEF3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GOLGA6L4A6NEF3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GOLGA6L4A6NEF3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GOLGA6L4A6NEF3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GOLGA6L4A6NEF3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GOLGA6L4A6NEF3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GOLGA6L4A6NEF3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GOLGA6L4A6NEF3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GOLGA6L4A6NEF3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GOLGA6L4A6NEF3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GOLGA6L4A6NEF3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GOLGA6L4A6NEF3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GOLGA6L4A6NEF3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GOLGA6L4A6NEF3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GOLGA6L4A6NEF3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GOLGA6L4A6NEF3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA6L4A6NEF3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA6L4A6NEF3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA6L4A6NEF3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA6L4A6NEF3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA6L4A6NEF3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA6L4A6NEF3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA6L4A6NEF3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA6L4A6NEF3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA6L4A6NEF3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GOLGA6L4A6NEF3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA6L4A6NEF3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA6L4A6NEF3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA6L4A6NEF3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GOLGA6L4A6NEF3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GOLGA6L4A6NEF3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GOLGA6L4A6NEF3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GOLGA6L4A6NEF3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA6L4A6NEF3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA6L4A6NEF3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA6L4A6NEF3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA6L4A6NEF3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA6L4A6NEF3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA6L4A6NEF3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GOLGA6L4A6NEF3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA6L4A6NEF3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA6L4A6NEF3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA6L4A6NEF3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA6L4A6NEF3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms