Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6BA6NDN3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6BA6NDN3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6BA6NDN3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6BA6NDN3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6BA6NDN3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6BA6NDN3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6BA6NDN3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6BA6NDN3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6BA6NDN3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6BA6NDN3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6BA6NDN3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6BA6NDN3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6BA6NDN3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6BA6NDN3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA6BA6NDN3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA6BA6NDN3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA6BA6NDN3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6BA6NDN3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6BA6NDN3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6BA6NDN3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6BA6NDN3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6BA6NDN3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLGA6BA6NDN3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLGA6BA6NDN3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLGA6BA6NDN3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GOLGA6BA6NDN3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GOLGA6BA6NDN3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6BA6NDN3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6BA6NDN3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6BA6NDN3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6BA6NDN3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6BA6NDN3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6BA6NDN3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6BA6NDN3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6BA6NDN3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6BA6NDN3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6BA6NDN3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6BA6NDN3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6BA6NDN3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOLGA6BA6NDN3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOLGA6BA6NDN3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOLGA6BA6NDN3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA6BA6NDN3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6BA6NDN3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA6BA6NDN3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms