Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA6CA6NDK9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA6CA6NDK9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA6CA6NDK9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA6CA6NDK9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA6CA6NDK9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA6CA6NDK9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6CA6NDK9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6CA6NDK9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6CA6NDK9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6CA6NDK9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6CA6NDK9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6CA6NDK9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6CA6NDK9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLGA6CA6NDK9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA6CA6NDK9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA6CA6NDK9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA6CA6NDK9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA6CA6NDK9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6CA6NDK9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6CA6NDK9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA6CA6NDK9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA6CA6NDK9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOLGA6CA6NDK9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOLGA6CA6NDK9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GOLGA6CA6NDK9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6CA6NDK9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6CA6NDK9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6CA6NDK9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6CA6NDK9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6CA6NDK9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6CA6NDK9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6CA6NDK9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6CA6NDK9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6CA6NDK9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6CA6NDK9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOLGA6CA6NDK9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOLGA6CA6NDK9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOLGA6CA6NDK9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOLGA6CA6NDK9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GOLGA6CA6NDK9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA6CA6NDK9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6CA6NDK9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GOLGA6CA6NDK9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA6CA6NDK9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6CA6NDK9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6CA6NDK9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6CA6NDK9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6CA6NDK9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6CA6NDK9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6CA6NDK9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA6CA6NDK9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA6CA6NDK9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA6CA6NDK9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6CA6NDK9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6CA6NDK9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6CA6NDK9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms