Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LAMB4A4D0S4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LAMB4A4D0S4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LAMB4A4D0S4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LAMB4A4D0S4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LAMB4A4D0S4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LAMB4A4D0S4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LAMB4A4D0S4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LAMB4A4D0S4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LAMB4A4D0S4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LAMB4A4D0S4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LAMB4A4D0S4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LAMB4A4D0S4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LAMB4A4D0S4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LAMB4A4D0S4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LAMB4A4D0S4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LAMB4A4D0S4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LAMB4A4D0S4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LAMB4A4D0S4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LAMB4A4D0S4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LAMB4A4D0S4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LAMB4A4D0S4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LAMB4A4D0S4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LAMB4A4D0S4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LAMB4A4D0S4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
LAMB4A4D0S4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LAMB4A4D0S4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LAMB4A4D0S4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LAMB4A4D0S4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
LAMB4A4D0S4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LAMB4A4D0S4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LAMB4A4D0S4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LAMB4A4D0S4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LAMB4A4D0S4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LAMB4A4D0S4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LAMB4A4D0S4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LAMB4A4D0S4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LAMB4A4D0S4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
LAMB4A4D0S4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LAMB4A4D0S4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
LAMB4A4D0S4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LAMB4A4D0S4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LAMB4A4D0S4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LAMB4A4D0S4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LAMB4A4D0S4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
LAMB4A4D0S4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
LAMB4A4D0S4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LAMB4A4D0S4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LAMB4A4D0S4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LAMB4A4D0S4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LAMB4A4D0S4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LAMB4A4D0S4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LAMB4A4D0S4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LAMB4A4D0S4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
LAMB4A4D0S4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LAMB4A4D0S4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LAMB4A4D0S4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LAMB4A4D0S4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LAMB4A4D0S4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LAMB4A4D0S4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LAMB4A4D0S4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LAMB4A4D0S4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMB4A4D0S4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
LAMB4A4D0S4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LAMB4A4D0S4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LAMB4A4D0S4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LAMB4A4D0S4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LAMB4A4D0S4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LAMB4A4D0S4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LAMB4A4D0S4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LAMB4A4D0S4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LAMB4A4D0S4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LAMB4A4D0S4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
LAMB4A4D0S4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LAMB4A4D0S4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMB4A4D0S4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
LAMB4A4D0S4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LAMB4A4D0S4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34■■■■□ 3.03
LAMB4A4D0S4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMB4A4D0S4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMB4A4D0S4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMB4A4D0S4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMB4A4D0S4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms