Protein–RNA interactions for Protein: A2NJV5

IGKV2-29, Immunoglobulin kappa variable 2-29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-29A2NJV5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGKV2-29A2NJV5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKV2-29A2NJV5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKV2-29A2NJV5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV2-29A2NJV5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV2-29A2NJV5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms