Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTI8

TMEM272, Transmembrane protein 272, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM272A0A1B0GTI8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM272A0A1B0GTI8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM272A0A1B0GTI8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM272A0A1B0GTI8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM272A0A1B0GTI8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM272A0A1B0GTI8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM272A0A1B0GTI8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM272A0A1B0GTI8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM272A0A1B0GTI8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM272A0A1B0GTI8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM272A0A1B0GTI8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM272A0A1B0GTI8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM272A0A1B0GTI8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM272A0A1B0GTI8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM272A0A1B0GTI8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM272A0A1B0GTI8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM272A0A1B0GTI8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM272A0A1B0GTI8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM272A0A1B0GTI8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM272A0A1B0GTI8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM272A0A1B0GTI8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM272A0A1B0GTI8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM272A0A1B0GTI8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM272A0A1B0GTI8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM272A0A1B0GTI8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM272A0A1B0GTI8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM272A0A1B0GTI8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM272A0A1B0GTI8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM272A0A1B0GTI8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM272A0A1B0GTI8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM272A0A1B0GTI8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM272A0A1B0GTI8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM272A0A1B0GTI8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM272A0A1B0GTI8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM272A0A1B0GTI8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM272A0A1B0GTI8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM272A0A1B0GTI8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM272A0A1B0GTI8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM272A0A1B0GTI8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM272A0A1B0GTI8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM272A0A1B0GTI8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms