Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0J9YVX5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0J9YVX5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0J9YVX5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0J9YVX5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0J9YVX5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0J9YVX5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0J9YVX5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0J9YVX5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0J9YVX5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0J9YVX5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0J9YVX5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0J9YVX5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0J9YVX5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0J9YVX5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0J9YVX5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0J9YVX5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0J9YVX5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0J9YVX5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0J9YVX5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0J9YVX5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0J9YVX5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0J9YVX5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0J9YVX5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0J9YVX5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
A0A0J9YVX5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A0J9YVX5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0J9YVX5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0J9YVX5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0J9YVX5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms