Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J203

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J203 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0B4J203 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0B4J203 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0B4J203 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0B4J203 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms