Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J203

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J203 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0B4J203 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0B4J203 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0B4J203 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0B4J203 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J203 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0B4J203 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0B4J203 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0B4J203 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J203 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms