Protein–RNA interactions for Protein: A0A096LPE4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A096LPE4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A096LPE4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A096LPE4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A096LPE4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A096LPE4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A096LPE4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A096LPE4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A096LPE4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A096LPE4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A096LPE4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A096LPE4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPE4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPE4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPE4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPE4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPE4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A096LPE4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A096LPE4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A096LPE4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A096LPE4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A096LPE4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A096LPE4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A096LPE4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A096LPE4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms