Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM9

MEIKIN, Meiosis-specific kinetochore protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIKINA0A087WXM9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEIKINA0A087WXM9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIKINA0A087WXM9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIKINA0A087WXM9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIKINA0A087WXM9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIKINA0A087WXM9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIKINA0A087WXM9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIKINA0A087WXM9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIKINA0A087WXM9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIKINA0A087WXM9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIKINA0A087WXM9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIKINA0A087WXM9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIKINA0A087WXM9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIKINA0A087WXM9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIKINA0A087WXM9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIKINA0A087WXM9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MEIKINA0A087WXM9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIKINA0A087WXM9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms