Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.51■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT24Q2M2I5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms