RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.25■■■■■ 4.99
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.46■■■■□ 3.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.2■■■■□ 3.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.62■■■■□ 3.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.91■■■■□ 3.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCC9O60706 1549 aa37.08■■■■□ 3.53
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SCRIBQ14160 1630 aa37.01■■■■□ 3.51
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.98■■■■□ 3.51
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.9■■■■□ 3.5
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NACADO15069 1562 aa36.64■■■■□ 3.46
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.15■■■■□ 3.38
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.14■■■■□ 3.38
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.95■■■■□ 3.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.83■■■■□ 3.33
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WIZO95785 1651 aa35.71■■■■□ 3.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRIM41Q8WV44 630 aa35.63■■■■□ 3.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.51■■■■□ 3.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.41■■■■□ 3.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.32■■■■□ 3.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMARCA4P51532 1647 aa35.3■■■■□ 3.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.17■■■■□ 3.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.11■■■■□ 3.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.03■■■■□ 3.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HRCP23327 699 aa34.94■■■■□ 3.18
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMARCA2P51531 1590 aa34.93■■■■□ 3.18
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCC8Q09428 1581 aa34.78■■■■□ 3.16
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.61■■■■□ 3.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.55■■■■□ 3.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SOGA1O94964 1423 aa34.39■■■■□ 3.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.27■■■■□ 3.08
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.24■■■■□ 3.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.16■■■■□ 3.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EEA1Q15075 1411 aa34.08■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SYNJ1O43426 1573 aa34.08■■■■□ 3.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CEP162Q5TB80 1403 aa34■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.97■■■■□ 3.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NCAPD3P42695 1498 aa33.94■■■■□ 3.02
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HMGXB3Q12766 1538 aa33.87■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GOLGA3Q08378 1498 aa33.86■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.71■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TOP2BQ02880 1626 aa33.68■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF21BO75037 1637 aa33.61■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.56■■■□□ 2.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CFTRP13569 1480 aa33.54■■■□□ 2.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.54■■■□□ 2.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CUX1P39880 1505 aa33.5■■■□□ 2.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLIP1P30622 1438 aa33.48■■■□□ 2.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.33■■■□□ 2.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.29■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRXQ9BXM0 1461 aa33.26■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF27Q86VH2 1401 aa33.25■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.25■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.16■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 APLP2Q06481 763 aa33.15■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRDM2Q13029 1718 aa33.11■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CUX2O14529 1486 aa33.05■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.99■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARAP1Q96P48 1450 aa32.97■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.97■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGF1RP08069 1367 aa32.94■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NESP48681 1621 aa32.89■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.8■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.77■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.74■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.72■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.69■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TOPBP1Q92547 1522 aa32.69■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.57■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.53■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 P3H3Q8IVL6 736 aa32.52■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.4■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ITGAEP38570 1179 aa32.34■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.33■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.3■■■□□ 2.76
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