Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ITGAEP38570 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms