Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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