RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610222.1

SYT6-209, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SYT6, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-209ENST00000610222 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.09■■■■■ 5.61
SYT6-209ENST00000610222 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.14■■■■■ 4.66
SYT6-209ENST00000610222 ABCC9O60706 1549 aa42.26■■■■■ 4.36
SYT6-209ENST00000610222 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
SYT6-209ENST00000610222 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.53■■■■■ 4.24
SYT6-209ENST00000610222 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.44■■■■■ 4.22
SYT6-209ENST00000610222 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.22■■■■■ 4.19
SYT6-209ENST00000610222 NACADO15069 1562 aa41.21■■■■■ 4.19
SYT6-209ENST00000610222 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.05■■■■■ 4.16
SYT6-209ENST00000610222 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.93■■■■■ 4.14
SYT6-209ENST00000610222 SCRIBQ14160 1630 aa40.42■■■■■ 4.06
SYT6-209ENST00000610222 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.26■■■■■ 4.04
SYT6-209ENST00000610222 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.78■■■■□ 3.96
SYT6-209ENST00000610222 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.64■■■■□ 3.94
SYT6-209ENST00000610222 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
SYT6-209ENST00000610222 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.93■■■■□ 3.82
SYT6-209ENST00000610222 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.82■■■■□ 3.8
SYT6-209ENST00000610222 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
SYT6-209ENST00000610222 SMARCA4P51532 1647 aa38.71■■■■□ 3.79
SYT6-209ENST00000610222 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
SYT6-209ENST00000610222 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.65■■■■□ 3.78
SYT6-209ENST00000610222 WIZO95785 1651 aa38.35■■■■□ 3.73
SYT6-209ENST00000610222 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.28■■■■□ 3.72
SYT6-209ENST00000610222 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.26■■■■□ 3.72
SYT6-209ENST00000610222 SMARCA2P51531 1590 aa38.21■■■■□ 3.71
SYT6-209ENST00000610222 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.19■■■■□ 3.7
SYT6-209ENST00000610222 NCAPD3P42695 1498 aa37.98■■■■□ 3.67
SYT6-209ENST00000610222 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
SYT6-209ENST00000610222 HMGXB3Q12766 1538 aa37.94■■■■□ 3.66
SYT6-209ENST00000610222 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
SYT6-209ENST00000610222 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.82■■■■□ 3.65
SYT6-209ENST00000610222 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.77■■■■□ 3.64
SYT6-209ENST00000610222 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.54■■■■□ 3.6
SYT6-209ENST00000610222 TRIM41Q8WV44 630 aa37.01■■■■□ 3.51
SYT6-209ENST00000610222 CFTRP13569 1480 aa36.94■■■■□ 3.5
SYT6-209ENST00000610222 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.94■■■■□ 3.5
SYT6-209ENST00000610222 PRDM2Q13029 1718 aa36.9■■■■□ 3.5
SYT6-209ENST00000610222 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.89■■■■□ 3.5
SYT6-209ENST00000610222 NESP48681 1621 aa36.87■■■■□ 3.49
SYT6-209ENST00000610222 ABCC8Q09428 1581 aa36.82■■■■□ 3.48
SYT6-209ENST00000610222 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.56■■■■□ 3.44
SYT6-209ENST00000610222 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.56■■■■□ 3.44
SYT6-209ENST00000610222 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.53■■■■□ 3.44
SYT6-209ENST00000610222 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.51■■■■□ 3.44
SYT6-209ENST00000610222 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.44■■■■□ 3.42
SYT6-209ENST00000610222 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
SYT6-209ENST00000610222 SYNJ1O43426 1573 aa36.39■■■■□ 3.42
SYT6-209ENST00000610222 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.39■■■■□ 3.42
SYT6-209ENST00000610222 ERCC6Q03468 1493 aa36.35■■■■□ 3.41
SYT6-209ENST00000610222 CUX1P39880 1505 aa36.21■■■■□ 3.39
SYT6-209ENST00000610222 TOP2BQ02880 1626 aa36.19■■■■□ 3.38
SYT6-209ENST00000610222 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.17■■■■□ 3.38
SYT6-209ENST00000610222 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.16■■■■□ 3.38
SYT6-209ENST00000610222 SOGA1O94964 1423 aa36.15■■■■□ 3.38
SYT6-209ENST00000610222 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.15■■■■□ 3.38
SYT6-209ENST00000610222 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
SYT6-209ENST00000610222 TOPBP1Q92547 1522 aa36.1■■■■□ 3.37
SYT6-209ENST00000610222 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
SYT6-209ENST00000610222 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.04■■■■□ 3.36
SYT6-209ENST00000610222 WDR62O43379 1518 aa36.01■■■■□ 3.35
SYT6-209ENST00000610222 EEA1Q15075 1411 aa35.97■■■■□ 3.35
SYT6-209ENST00000610222 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.94■■■■□ 3.34
SYT6-209ENST00000610222 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.93■■■■□ 3.34
SYT6-209ENST00000610222 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
SYT6-209ENST00000610222 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.86■■■■□ 3.33
SYT6-209ENST00000610222 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.71■■■■□ 3.31
SYT6-209ENST00000610222 CUX2O14529 1486 aa35.68■■■■□ 3.3
SYT6-209ENST00000610222 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
SYT6-209ENST00000610222 WDR97A6NE52 1622 aa35.63■■■■□ 3.29
SYT6-209ENST00000610222 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.59■■■■□ 3.29
SYT6-209ENST00000610222 IFT140Q96RY7 1462 aa35.59■■■■□ 3.29
SYT6-209ENST00000610222 KIF27Q86VH2 1401 aa35.56■■■■□ 3.28
SYT6-209ENST00000610222 KIF21BO75037 1637 aa35.54■■■■□ 3.28
SYT6-209ENST00000610222 GOLGA3Q08378 1498 aa35.54■■■■□ 3.28
SYT6-209ENST00000610222 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.45■■■■□ 3.27
SYT6-209ENST00000610222 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
SYT6-209ENST00000610222 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.41■■■■□ 3.26
SYT6-209ENST00000610222 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
SYT6-209ENST00000610222 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
SYT6-209ENST00000610222 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.39■■■■□ 3.26
SYT6-209ENST00000610222 PRXQ9BXM0 1461 aa35.37■■■■□ 3.25
SYT6-209ENST00000610222 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
SYT6-209ENST00000610222 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.33■■■■□ 3.25
SYT6-209ENST00000610222 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.31■■■■□ 3.24
SYT6-209ENST00000610222 CEP162Q5TB80 1403 aa35.3■■■■□ 3.24
SYT6-209ENST00000610222 PBRM1Q86U86 1689 aa35.29■■■■□ 3.24
SYT6-209ENST00000610222 IGF1RP08069 1367 aa35.28■■■■□ 3.24
SYT6-209ENST00000610222 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.27■■■■□ 3.24
SYT6-209ENST00000610222 GRIN2BQ13224 1484 aa35.17■■■■□ 3.22
SYT6-209ENST00000610222 CUL7Q14999 1698 aa35.12■■■■□ 3.21
SYT6-209ENST00000610222 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.08■■■■□ 3.21
SYT6-209ENST00000610222 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.02■■■■□ 3.2
SYT6-209ENST00000610222 ADAMTS12P58397 1594 aa35■■■■□ 3.19
SYT6-209ENST00000610222 CLIP1P30622 1438 aa34.99■■■■□ 3.19
SYT6-209ENST00000610222 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
SYT6-209ENST00000610222 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.93■■■■□ 3.18
SYT6-209ENST00000610222 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
SYT6-209ENST00000610222 SYNJ2O15056 1496 aa34.83■■■■□ 3.17
SYT6-209ENST00000610222 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.78■■■■□ 3.16
SYT6-209ENST00000610222 CHD1O14646 1710 aa34.76■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms