RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595923.5

CREB3L3-202, Transcript of cAMP responsive element binding protein 3 like 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CREB3L3, Length 1,491 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3-202ENST00000595923 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.16■■■■■ 5.78
CREB3L3-202ENST00000595923 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.72■■■■■ 4.91
CREB3L3-202ENST00000595923 ABCC9O60706 1549 aa44.76■■■■■ 4.76
CREB3L3-202ENST00000595923 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.04■■■■■ 4.48
CREB3L3-202ENST00000595923 NACADO15069 1562 aa42.9■■■■■ 4.46
CREB3L3-202ENST00000595923 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.72■■■■■ 4.43
CREB3L3-202ENST00000595923 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.41
CREB3L3-202ENST00000595923 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.54■■■■■ 4.4
CREB3L3-202ENST00000595923 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.32■■■■■ 4.37
CREB3L3-202ENST00000595923 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.21■■■■■ 4.35
CREB3L3-202ENST00000595923 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.71■■■■■ 4.27
CREB3L3-202ENST00000595923 SCRIBQ14160 1630 aa41.69■■■■■ 4.26
CREB3L3-202ENST00000595923 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.69■■■■■ 4.26
CREB3L3-202ENST00000595923 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.25■■■■■ 4.19
CREB3L3-202ENST00000595923 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.04■■■■■ 4.16
CREB3L3-202ENST00000595923 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
CREB3L3-202ENST00000595923 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.53■■■■■ 4.08
CREB3L3-202ENST00000595923 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.21■■■■■ 4.03
CREB3L3-202ENST00000595923 SMARCA4P51532 1647 aa39.83■■■■□ 3.97
CREB3L3-202ENST00000595923 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
CREB3L3-202ENST00000595923 SMARCA2P51531 1590 aa39.55■■■■□ 3.92
CREB3L3-202ENST00000595923 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.53■■■■□ 3.92
CREB3L3-202ENST00000595923 NCAPD3P42695 1498 aa39.49■■■■□ 3.91
CREB3L3-202ENST00000595923 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.44■■■■□ 3.9
CREB3L3-202ENST00000595923 HMGXB3Q12766 1538 aa39.41■■■■□ 3.9
CREB3L3-202ENST00000595923 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.38■■■■□ 3.9
CREB3L3-202ENST00000595923 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
CREB3L3-202ENST00000595923 WIZO95785 1651 aa39.1■■■■□ 3.85
CREB3L3-202ENST00000595923 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
CREB3L3-202ENST00000595923 NESP48681 1621 aa38.68■■■■□ 3.78
CREB3L3-202ENST00000595923 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.64■■■■□ 3.78
CREB3L3-202ENST00000595923 ERCC6Q03468 1493 aa38.62■■■■□ 3.77
CREB3L3-202ENST00000595923 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.61■■■■□ 3.77
CREB3L3-202ENST00000595923 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.38■■■■□ 3.73
CREB3L3-202ENST00000595923 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.32■■■■□ 3.73
CREB3L3-202ENST00000595923 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.25■■■■□ 3.71
CREB3L3-202ENST00000595923 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
CREB3L3-202ENST00000595923 CUX2O14529 1486 aa38.23■■■■□ 3.71
CREB3L3-202ENST00000595923 CFTRP13569 1480 aa38.11■■■■□ 3.69
CREB3L3-202ENST00000595923 PRDM2Q13029 1718 aa38.1■■■■□ 3.69
CREB3L3-202ENST00000595923 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.09■■■■□ 3.69
CREB3L3-202ENST00000595923 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.98■■■■□ 3.67
CREB3L3-202ENST00000595923 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.97■■■■□ 3.67
CREB3L3-202ENST00000595923 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.94■■■■□ 3.66
CREB3L3-202ENST00000595923 WDR62O43379 1518 aa37.85■■■■□ 3.65
CREB3L3-202ENST00000595923 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
CREB3L3-202ENST00000595923 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
CREB3L3-202ENST00000595923 TOPBP1Q92547 1522 aa37.36■■■■□ 3.57
CREB3L3-202ENST00000595923 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.35■■■■□ 3.57
CREB3L3-202ENST00000595923 ABCC8Q09428 1581 aa37.31■■■■□ 3.56
CREB3L3-202ENST00000595923 IFT140Q96RY7 1462 aa37.14■■■■□ 3.54
CREB3L3-202ENST00000595923 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.08■■■■□ 3.53
CREB3L3-202ENST00000595923 CUX1P39880 1505 aa37.03■■■■□ 3.52
CREB3L3-202ENST00000595923 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
CREB3L3-202ENST00000595923 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
CREB3L3-202ENST00000595923 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
CREB3L3-202ENST00000595923 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
CREB3L3-202ENST00000595923 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.93■■■■□ 3.5
CREB3L3-202ENST00000595923 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.84■■■■□ 3.49
CREB3L3-202ENST00000595923 SOGA1O94964 1423 aa36.81■■■■□ 3.48
CREB3L3-202ENST00000595923 WDR97A6NE52 1622 aa36.77■■■■□ 3.48
CREB3L3-202ENST00000595923 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.76■■■■□ 3.48
CREB3L3-202ENST00000595923 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.72■■■■□ 3.47
CREB3L3-202ENST00000595923 SYNJ1O43426 1573 aa36.71■■■■□ 3.47
CREB3L3-202ENST00000595923 TOP2BQ02880 1626 aa36.71■■■■□ 3.47
CREB3L3-202ENST00000595923 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.69■■■■□ 3.46
CREB3L3-202ENST00000595923 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
CREB3L3-202ENST00000595923 CHD1O14646 1710 aa36.59■■■■□ 3.45
CREB3L3-202ENST00000595923 PBRM1Q86U86 1689 aa36.56■■■■□ 3.44
CREB3L3-202ENST00000595923 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.53■■■■□ 3.44
CREB3L3-202ENST00000595923 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.51■■■■□ 3.44
CREB3L3-202ENST00000595923 OSCARQ8IYS5 282 aa36.49■■■■□ 3.43
CREB3L3-202ENST00000595923 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.46■■■■□ 3.43
CREB3L3-202ENST00000595923 GRIN2BQ13224 1484 aa36.44■■■■□ 3.42
CREB3L3-202ENST00000595923 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.43■■■■□ 3.42
CREB3L3-202ENST00000595923 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
CREB3L3-202ENST00000595923 FBLN2P98095 1184 aa36.31■■■■□ 3.4
CREB3L3-202ENST00000595923 SYNJ2O15056 1496 aa36.24■■■■□ 3.39
CREB3L3-202ENST00000595923 ADAMTS12P58397 1594 aa36.18■■■■□ 3.38
CREB3L3-202ENST00000595923 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
CREB3L3-202ENST00000595923 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.14■■■■□ 3.38
CREB3L3-202ENST00000595923 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.14■■■■□ 3.38
CREB3L3-202ENST00000595923 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.14■■■■□ 3.38
CREB3L3-202ENST00000595923 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.13■■■■□ 3.37
CREB3L3-202ENST00000595923 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.06■■■■□ 3.36
CREB3L3-202ENST00000595923 ARHGEF11O15085 1522 aa36.06■■■■□ 3.36
CREB3L3-202ENST00000595923 GRIN2AQ12879 1464 aa36■■■■□ 3.35
CREB3L3-202ENST00000595923 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.98■■■■□ 3.35
CREB3L3-202ENST00000595923 KIF27Q86VH2 1401 aa35.93■■■■□ 3.34
CREB3L3-202ENST00000595923 TRIM41Q8WV44 630 aa35.91■■■■□ 3.34
CREB3L3-202ENST00000595923 CEP170Q5SW79 1584 aa35.88■■■■□ 3.33
CREB3L3-202ENST00000595923 CUL7Q14999 1698 aa35.87■■■■□ 3.33
CREB3L3-202ENST00000595923 NUP160Q12769 1436 aa35.8■■■■□ 3.32
CREB3L3-202ENST00000595923 ARAP1Q96P48 1450 aa35.74■■■■□ 3.31
CREB3L3-202ENST00000595923 IGF1RP08069 1367 aa35.71■■■■□ 3.31
CREB3L3-202ENST00000595923 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.67■■■■□ 3.3
CREB3L3-202ENST00000595923 SHROOM2Q13796 1616 aa35.65■■■■□ 3.3
CREB3L3-202ENST00000595923 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.6■■■■□ 3.29
CREB3L3-202ENST00000595923 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.55■■■■□ 3.28
CREB3L3-202ENST00000595923 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.54■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms