Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms