RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266987.6

TARBP2-201, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TARBP2, Length 1,867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP2-201ENST00000266987 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.89■■■■■ 5.58
TARBP2-201ENST00000266987 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.58■■■■■ 4.57
TARBP2-201ENST00000266987 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
TARBP2-201ENST00000266987 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.35■■■■■ 4.21
TARBP2-201ENST00000266987 ABCC9O60706 1549 aa41.09■■■■■ 4.17
TARBP2-201ENST00000266987 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.94■■■■■ 4.14
TARBP2-201ENST00000266987 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.92■■■■■ 4.14
TARBP2-201ENST00000266987 NACADO15069 1562 aa40.58■■■■■ 4.09
TARBP2-201ENST00000266987 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.42■■■■■ 4.06
TARBP2-201ENST00000266987 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.2■■■■■ 4.03
TARBP2-201ENST00000266987 SCRIBQ14160 1630 aa39.92■■■■□ 3.98
TARBP2-201ENST00000266987 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.42■■■■□ 3.9
TARBP2-201ENST00000266987 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.04■■■■□ 3.84
TARBP2-201ENST00000266987 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
TARBP2-201ENST00000266987 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.72■■■■□ 3.79
TARBP2-201ENST00000266987 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.68■■■■□ 3.78
TARBP2-201ENST00000266987 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
TARBP2-201ENST00000266987 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
TARBP2-201ENST00000266987 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.51■■■■□ 3.75
TARBP2-201ENST00000266987 SMARCA4P51532 1647 aa38.36■■■■□ 3.73
TARBP2-201ENST00000266987 WIZO95785 1651 aa38.17■■■■□ 3.7
TARBP2-201ENST00000266987 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.99■■■■□ 3.67
TARBP2-201ENST00000266987 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
TARBP2-201ENST00000266987 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
TARBP2-201ENST00000266987 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.74■■■■□ 3.63
TARBP2-201ENST00000266987 SMARCA2P51531 1590 aa37.72■■■■□ 3.63
TARBP2-201ENST00000266987 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
TARBP2-201ENST00000266987 NCAPD3P42695 1498 aa37.47■■■■□ 3.59
TARBP2-201ENST00000266987 HMGXB3Q12766 1538 aa37.41■■■■□ 3.58
TARBP2-201ENST00000266987 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.4■■■■□ 3.58
TARBP2-201ENST00000266987 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.3■■■■□ 3.56
TARBP2-201ENST00000266987 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.26■■■■□ 3.55
TARBP2-201ENST00000266987 TRIM41Q8WV44 630 aa36.62■■■■□ 3.45
TARBP2-201ENST00000266987 CFTRP13569 1480 aa36.61■■■■□ 3.45
TARBP2-201ENST00000266987 ABCC8Q09428 1581 aa36.55■■■■□ 3.44
TARBP2-201ENST00000266987 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.45■■■■□ 3.42
TARBP2-201ENST00000266987 PRDM2Q13029 1718 aa36.43■■■■□ 3.42
TARBP2-201ENST00000266987 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.37■■■■□ 3.41
TARBP2-201ENST00000266987 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.31■■■■□ 3.4
TARBP2-201ENST00000266987 SYNJ1O43426 1573 aa36.23■■■■□ 3.39
TARBP2-201ENST00000266987 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.18■■■■□ 3.38
TARBP2-201ENST00000266987 TOP2BQ02880 1626 aa36.13■■■■□ 3.37
TARBP2-201ENST00000266987 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.1■■■■□ 3.37
TARBP2-201ENST00000266987 NESP48681 1621 aa36.08■■■■□ 3.37
TARBP2-201ENST00000266987 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.02■■■■□ 3.36
TARBP2-201ENST00000266987 CUX1P39880 1505 aa36.01■■■■□ 3.36
TARBP2-201ENST00000266987 SOGA1O94964 1423 aa35.87■■■■□ 3.33
TARBP2-201ENST00000266987 EEA1Q15075 1411 aa35.86■■■■□ 3.33
TARBP2-201ENST00000266987 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.85■■■■□ 3.33
TARBP2-201ENST00000266987 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
TARBP2-201ENST00000266987 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.79■■■■□ 3.32
TARBP2-201ENST00000266987 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.79■■■■□ 3.32
TARBP2-201ENST00000266987 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.73■■■■□ 3.31
TARBP2-201ENST00000266987 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.72■■■■□ 3.31
TARBP2-201ENST00000266987 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.69■■■■□ 3.3
TARBP2-201ENST00000266987 TOPBP1Q92547 1522 aa35.65■■■■□ 3.3
TARBP2-201ENST00000266987 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.6■■■■□ 3.29
TARBP2-201ENST00000266987 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.59■■■■□ 3.29
TARBP2-201ENST00000266987 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
TARBP2-201ENST00000266987 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
TARBP2-201ENST00000266987 KIF27Q86VH2 1401 aa35.45■■■■□ 3.26
TARBP2-201ENST00000266987 KIF21BO75037 1637 aa35.4■■■■□ 3.26
TARBP2-201ENST00000266987 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.39■■■■□ 3.26
TARBP2-201ENST00000266987 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.36■■■■□ 3.25
TARBP2-201ENST00000266987 CUX2O14529 1486 aa35.33■■■■□ 3.25
TARBP2-201ENST00000266987 GOLGA3Q08378 1498 aa35.3■■■■□ 3.24
TARBP2-201ENST00000266987 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.29■■■■□ 3.24
TARBP2-201ENST00000266987 WDR62O43379 1518 aa35.27■■■■□ 3.24
TARBP2-201ENST00000266987 PRXQ9BXM0 1461 aa35.26■■■■□ 3.24
TARBP2-201ENST00000266987 WDR97A6NE52 1622 aa35.26■■■■□ 3.23
TARBP2-201ENST00000266987 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.23■■■■□ 3.23
TARBP2-201ENST00000266987 ERCC6Q03468 1493 aa35.21■■■■□ 3.23
TARBP2-201ENST00000266987 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.21■■■■□ 3.23
TARBP2-201ENST00000266987 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.19■■■■□ 3.22
TARBP2-201ENST00000266987 IGF1RP08069 1367 aa35.17■■■■□ 3.22
TARBP2-201ENST00000266987 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
TARBP2-201ENST00000266987 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
TARBP2-201ENST00000266987 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.16■■■■□ 3.22
TARBP2-201ENST00000266987 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.07■■■■□ 3.21
TARBP2-201ENST00000266987 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
TARBP2-201ENST00000266987 CEP162Q5TB80 1403 aa34.98■■■■□ 3.19
TARBP2-201ENST00000266987 IFT140Q96RY7 1462 aa34.97■■■■□ 3.19
TARBP2-201ENST00000266987 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.94■■■■□ 3.18
TARBP2-201ENST00000266987 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.94■■■■□ 3.18
TARBP2-201ENST00000266987 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
TARBP2-201ENST00000266987 CUL7Q14999 1698 aa34.92■■■■□ 3.18
TARBP2-201ENST00000266987 PBRM1Q86U86 1689 aa34.76■■■■□ 3.16
TARBP2-201ENST00000266987 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.74■■■■□ 3.154e-7■■■■□ 23.7
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TARBP2-201ENST00000266987 CLIP1P30622 1438 aa34.72■■■■□ 3.15
TARBP2-201ENST00000266987 GRIN2BQ13224 1484 aa34.69■■■■□ 3.14
TARBP2-201ENST00000266987 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
TARBP2-201ENST00000266987 ADAMTS12P58397 1594 aa34.59■■■■□ 3.13
TARBP2-201ENST00000266987 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.58■■■■□ 3.13
TARBP2-201ENST00000266987 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.5■■■■□ 3.11
TARBP2-201ENST00000266987 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.44■■■■□ 3.1
TARBP2-201ENST00000266987 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.44■■■■□ 3.1
TARBP2-201ENST00000266987 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
TARBP2-201ENST00000266987 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.43■■■■□ 3.1
TARBP2-201ENST00000266987 ARAP1Q96P48 1450 aa34.42■■■■□ 3.1
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