Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 ELOB-205ENST00000572954 331 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.627e-9■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 ATP1A1-211ENST00000537345 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.657e-9■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 ELOB-201ENST00000262306 582 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.697e-9■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 GANAB-202ENST00000356638 3608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.844e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 ELOB-204ENST00000494946 472 ntTSL 29.73□□□□□ -0.857e-9■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 NRDC-203ENST00000440943 1660 ntTSL 58.64□□□□□ -1.032e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 ATP1A1-205ENST00000440951 579 ntTSL 58.03□□□□□ -1.127e-9■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 NRDC-210ENST00000485608 3149 ntTSL 27.03□□□□□ -1.282e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.427e-9■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.522e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF2-209ENST00000586778 1001 ntTSL 23.9□□□□□ -1.792e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR4-204ENST00000466498 371 ntTSL 216.19■□□□□ 0.184e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-228ENST00000584141 564 ntTSL 220.24■□□□□ 0.831e-7■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-219ENST00000578757 920 ntTSL 1 (best)14.22□□□□□ -0.131e-7■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-201ENST00000460249 773 ntTSL 310.95□□□□□ -0.661e-7■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-216ENST00000492250 565 ntTSL 55.18□□□□□ -1.581e-7■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.45e-7■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 PDHA1-206ENST00000422285 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.425e-7■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 PDHA1-208ENST00000478795 791 ntTSL 212.14□□□□□ -0.475e-7■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.475e-7■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 PDHA1-204ENST00000379806 3484 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.665e-7■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.015e-7■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.64e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.044e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 211.17□□□□□ -0.624e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 HSP90B1-207ENST00000550595 694 ntTSL 24.12□□□□□ -1.754e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.968e-8■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.838e-8■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRIM28-206ENST00000595974 665 ntTSL 317.7■□□□□ 0.428e-8■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRIM28-213ENST00000598355 714 ntTSL 217.57■□□□□ 0.48e-8■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRIM28-207ENST00000597136 1552 ntTSL 216.07■□□□□ 0.168e-8■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 TMA7-202ENST00000477624 619 ntTSL 1 (best)23.43■■□□□ 1.345e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 TMA7-203ENST00000479126 688 ntTSL 222.36■■□□□ 1.175e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.845e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPA1-209ENST00000550482 832 ntTSL 216.33■□□□□ 0.22e-12■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.012e-12■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.092e-12■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPA1-206ENST00000547708 530 ntTSL 411.84□□□□□ -0.512e-12■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPA1-204ENST00000547276 1539 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.012e-12■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.647e-18■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.57e-18■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.447e-18■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.177e-18■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.087e-18■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 PLD3-212ENST00000486134 327 ntTSL 214.69□□□□□ -0.067e-18■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.071e-323■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.052e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.312e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 SERF2-211ENST00000430901 483 ntTSL 416.1■□□□□ 0.172e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 SERF2-208ENST00000409617 700 ntTSL 215.95■□□□□ 0.142e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.142e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 SERF2-212ENST00000445816 2099 ntTSL 314.83□□□□□ -0.032e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.082e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.112e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.132e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 SERF2-216ENST00000486144 1030 ntTSL 213.11□□□□□ -0.312e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 SERF2-213ENST00000448830 2792 ntTSL 213.04□□□□□ -0.322e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 SERF2-202ENST00000339624 506 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.462e-10■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPA1-212ENST00000551679 359 ntTSL 26.04□□□□□ -1.449e-15■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.942e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.692e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.682e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.642e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.572e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.43e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.232e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.022e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 EMP3-208ENST00000599255 667 ntTSL 314.74□□□□□ -0.052e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.193e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.22e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 EMP3-205ENST00000597057 406 ntTSL 212.75□□□□□ -0.372e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 EMP3-202ENST00000593437 502 ntTSL 511.53□□□□□ -0.562e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 EMP3-206ENST00000597279 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.622e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 EMP3-201ENST00000270221 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.732e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 TMBIM6-228ENST00000553022 540 ntTSL 29.19□□□□□ -0.942e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 TMBIM6-226ENST00000552635 574 ntTSL 47.4□□□□□ -1.222e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 GNG5-203ENST00000487806 557 ntTSL 34.28□□□□□ -1.722e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL23-205ENST00000470646 333 ntTSL 314.11□□□□□ -0.151e-13■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL23-202ENST00000378096 392 ntTSL 313.15□□□□□ -0.31e-13■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL23-209ENST00000584056 549 ntTSL 210.96□□□□□ -0.651e-13■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL23-208ENST00000577760 3081 nt9.95□□□□□ -0.821e-13■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.472e-19■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL30-211ENST00000521726 1129 ntTSL 316.4■□□□□ 0.222e-19■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL30-206ENST00000518850 614 ntTSL 215.98■□□□□ 0.152e-19■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL30-205ENST00000518164 1128 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.282e-19■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.282e-19■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL30-201ENST00000287038 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.312e-19■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL30-209ENST00000521291 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.632e-19■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL30-210ENST00000521534 573 ntTSL 21.98□□□□□ -2.092e-19■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-208ENST00000463092 968 ntTSL 215.91■□□□□ 0.141e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-218ENST00000491773 676 ntTSL 214.3□□□□□ -0.121e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-213ENST00000473012 632 ntTSL 313.6□□□□□ -0.231e-7■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.247e-13■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.097e-13■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 ERP29-201ENST00000261735 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.57e-13■□□□□ 8.7
APOBEC3CQ9NRW3 HIST1H3J-202ENST00000479986 522 ntTSL 224.08■■□□□ 1.456e-6■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 GPI-212ENST00000589985 1516 ntTSL 319.89■□□□□ 0.776e-6■□□□□ 8.6
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