RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477624.1

TMA7-202, Transcript of translation machinery associated 7 homolog, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMA7, Length 619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA7-202ENST00000477624 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.36■■■■■ 6.13
TMA7-202ENST00000477624 ABCC9O60706 1549 aa48.08■■■■■ 5.29
TMA7-202ENST00000477624 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.76■■■■■ 5.24
TMA7-202ENST00000477624 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.56■■■■■ 4.88
TMA7-202ENST00000477624 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.42■■■■■ 4.86
TMA7-202ENST00000477624 NACADO15069 1562 aa45.24■■■■■ 4.83
TMA7-202ENST00000477624 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.2■■■■■ 4.83
TMA7-202ENST00000477624 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.86■■■■■ 4.77
TMA7-202ENST00000477624 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.59■■■■■ 4.73
TMA7-202ENST00000477624 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.57■■■■■ 4.73
TMA7-202ENST00000477624 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.39■■■■■ 4.7
TMA7-202ENST00000477624 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
TMA7-202ENST00000477624 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.99■■■■■ 4.63
TMA7-202ENST00000477624 SCRIBQ14160 1630 aa43.64■■■■■ 4.58
TMA7-202ENST00000477624 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.55■■■■■ 4.56
TMA7-202ENST00000477624 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.37■■■■■ 4.53
TMA7-202ENST00000477624 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.28■■■■■ 4.52
TMA7-202ENST00000477624 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
TMA7-202ENST00000477624 NCAPD3P42695 1498 aa41.87■■■■■ 4.29
TMA7-202ENST00000477624 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.74■■■■■ 4.27
TMA7-202ENST00000477624 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.64■■■■■ 4.26
TMA7-202ENST00000477624 SMARCA4P51532 1647 aa41.6■■■■■ 4.25
TMA7-202ENST00000477624 SMARCA2P51531 1590 aa41.49■■■■■ 4.23
TMA7-202ENST00000477624 HMGXB3Q12766 1538 aa41.44■■■■■ 4.22
TMA7-202ENST00000477624 ERCC6Q03468 1493 aa41.41■■■■■ 4.22
TMA7-202ENST00000477624 CUX2O14529 1486 aa41.35■■■■■ 4.21
TMA7-202ENST00000477624 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
TMA7-202ENST00000477624 NESP48681 1621 aa41.33■■■■■ 4.21
TMA7-202ENST00000477624 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
TMA7-202ENST00000477624 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.18■■■■■ 4.18
TMA7-202ENST00000477624 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.17■■■■■ 4.18
TMA7-202ENST00000477624 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.83■■■■■ 4.13
TMA7-202ENST00000477624 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
TMA7-202ENST00000477624 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.66■■■■■ 4.1
TMA7-202ENST00000477624 WIZO95785 1651 aa40.64■■■■■ 4.1
TMA7-202ENST00000477624 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.64■■■■■ 4.1
TMA7-202ENST00000477624 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.61■■■■■ 4.09
TMA7-202ENST00000477624 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.31■■■■■ 4.04
TMA7-202ENST00000477624 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
TMA7-202ENST00000477624 WDR62O43379 1518 aa40.21■■■■■ 4.03
TMA7-202ENST00000477624 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.11■■■■■ 4.01
TMA7-202ENST00000477624 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.11■■■■■ 4.01
TMA7-202ENST00000477624 CFTRP13569 1480 aa40.1■■■■■ 4.01
TMA7-202ENST00000477624 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
TMA7-202ENST00000477624 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
TMA7-202ENST00000477624 TRIM41Q8WV44 630 aa39.76■■■■□ 3.96
TMA7-202ENST00000477624 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.7■■■■□ 3.95
TMA7-202ENST00000477624 OSCARQ8IYS5 282 aa39.57■■■■□ 3.93
TMA7-202ENST00000477624 PRDM2Q13029 1718 aa39.5■■■■□ 3.91
TMA7-202ENST00000477624 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
TMA7-202ENST00000477624 TOPBP1Q92547 1522 aa39.35■■■■□ 3.89
TMA7-202ENST00000477624 IFT140Q96RY7 1462 aa39.32■■■■□ 3.89
TMA7-202ENST00000477624 ABCC8Q09428 1581 aa39.15■■■■□ 3.86
TMA7-202ENST00000477624 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.12■■■■□ 3.85
TMA7-202ENST00000477624 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.04■■■■□ 3.849e-6■■□□□ 13.1
TMA7-202ENST00000477624 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
TMA7-202ENST00000477624 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.01■■■■□ 3.84
TMA7-202ENST00000477624 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.01■■■■□ 3.84
TMA7-202ENST00000477624 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.01■■■■□ 3.84
TMA7-202ENST00000477624 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
TMA7-202ENST00000477624 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
TMA7-202ENST00000477624 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.89■■■■□ 3.82
TMA7-202ENST00000477624 ARHGEF11O15085 1522 aa38.89■■■■□ 3.82
TMA7-202ENST00000477624 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
TMA7-202ENST00000477624 SOGA1O94964 1423 aa38.79■■■■□ 3.8
TMA7-202ENST00000477624 FBLN2P98095 1184 aa38.77■■■■□ 3.8
TMA7-202ENST00000477624 CHD1O14646 1710 aa38.77■■■■□ 3.8
TMA7-202ENST00000477624 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.71■■■■□ 3.79
TMA7-202ENST00000477624 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.68■■■■□ 3.78
TMA7-202ENST00000477624 CUX1P39880 1505 aa38.66■■■■□ 3.78
TMA7-202ENST00000477624 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.54■■■■□ 3.76
TMA7-202ENST00000477624 ARAP1Q96P48 1450 aa38.54■■■■□ 3.76
TMA7-202ENST00000477624 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
TMA7-202ENST00000477624 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.44■■■■□ 3.74
TMA7-202ENST00000477624 WDR97A6NE52 1622 aa38.42■■■■□ 3.74
TMA7-202ENST00000477624 GRIN2BQ13224 1484 aa38.4■■■■□ 3.74
TMA7-202ENST00000477624 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.37■■■■□ 3.73
TMA7-202ENST00000477624 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.36■■■■□ 3.73
TMA7-202ENST00000477624 SYNJ2O15056 1496 aa38.28■■■■□ 3.72
TMA7-202ENST00000477624 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.28■■■■□ 3.72
TMA7-202ENST00000477624 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.25■■■■□ 3.71
TMA7-202ENST00000477624 SYNJ1O43426 1573 aa38.24■■■■□ 3.71
TMA7-202ENST00000477624 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.21■■■■□ 3.71
TMA7-202ENST00000477624 PBRM1Q86U86 1689 aa38.17■■■■□ 3.7
TMA7-202ENST00000477624 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.13■■■■□ 3.69
TMA7-202ENST00000477624 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.03■■■■□ 3.68
TMA7-202ENST00000477624 TOP2BQ02880 1626 aa37.94■■■■□ 3.66
TMA7-202ENST00000477624 GRIN2AQ12879 1464 aa37.92■■■■□ 3.66
TMA7-202ENST00000477624 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.91■■■■□ 3.66
TMA7-202ENST00000477624 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.87■■■■□ 3.65
TMA7-202ENST00000477624 ADAMTS12P58397 1594 aa37.85■■■■□ 3.65
TMA7-202ENST00000477624 NUP160Q12769 1436 aa37.82■■■■□ 3.64
TMA7-202ENST00000477624 CEP170Q5SW79 1584 aa37.81■■■■□ 3.64
TMA7-202ENST00000477624 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.78■■■■□ 3.64
TMA7-202ENST00000477624 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.68■■■■□ 3.62
TMA7-202ENST00000477624 SHROOM2Q13796 1616 aa37.61■■■■□ 3.61
TMA7-202ENST00000477624 JPH4Q96JJ6 628 aa37.51■■■■□ 3.6
TMA7-202ENST00000477624 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
TMA7-202ENST00000477624 IGF1RP08069 1367 aa37.34■■■■□ 3.57
TMA7-202ENST00000477624 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.31■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms