Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.84■■■■■ 5.41
LAMC3Q9Y6N6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC48.84■■■■■ 5.41
LAMC3Q9Y6N6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC48.76■■■■■ 5.4
LAMC3Q9Y6N6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC48.73■■■■■ 5.39
LAMC3Q9Y6N6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC48.73■■■■■ 5.39
LAMC3Q9Y6N6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
LAMC3Q9Y6N6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC48.71■■■■■ 5.39
LAMC3Q9Y6N6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
LAMC3Q9Y6N6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
LAMC3Q9Y6N6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC48.65■■■■■ 5.38
LAMC3Q9Y6N6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
LAMC3Q9Y6N6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
LAMC3Q9Y6N6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
LAMC3Q9Y6N6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC48.58■■■■■ 5.37
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC48.57■■■■■ 5.37
LAMC3Q9Y6N6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
LAMC3Q9Y6N6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
LAMC3Q9Y6N6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.53■■■■■ 5.36
LAMC3Q9Y6N6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
LAMC3Q9Y6N6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC48.51■■■■■ 5.36
LAMC3Q9Y6N6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC48.51■■■■■ 5.36
LAMC3Q9Y6N6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
LAMC3Q9Y6N6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC48.48■■■■■ 5.35
LAMC3Q9Y6N6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.47■■■■■ 5.35
LAMC3Q9Y6N6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC48.45■■■■■ 5.35
LAMC3Q9Y6N6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.35
LAMC3Q9Y6N6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC48.43■■■■■ 5.34
LAMC3Q9Y6N6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
LAMC3Q9Y6N6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC48.4■■■■■ 5.34
LAMC3Q9Y6N6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC48.4■■■■■ 5.34
LAMC3Q9Y6N6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC48.4■■■■■ 5.34
LAMC3Q9Y6N6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC48.4■■■■■ 5.34
LAMC3Q9Y6N6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC48.39■■■■■ 5.34
LAMC3Q9Y6N6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC48.39■■■■■ 5.34
LAMC3Q9Y6N6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
LAMC3Q9Y6N6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC48.39■■■■■ 5.34
LAMC3Q9Y6N6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.33
LAMC3Q9Y6N6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.33
LAMC3Q9Y6N6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
LAMC3Q9Y6N6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC48.37■■■■■ 5.33
LAMC3Q9Y6N6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
LAMC3Q9Y6N6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
LAMC3Q9Y6N6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC48.36■■■■■ 5.33
LAMC3Q9Y6N6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
LAMC3Q9Y6N6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC48.32■■■■■ 5.33
LAMC3Q9Y6N6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
LAMC3Q9Y6N6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC48.3■■■■■ 5.32
LAMC3Q9Y6N6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.26■■■■■ 5.32
LAMC3Q9Y6N6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
LAMC3Q9Y6N6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
LAMC3Q9Y6N6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
LAMC3Q9Y6N6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
LAMC3Q9Y6N6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC48.22■■■■■ 5.31
LAMC3Q9Y6N6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
LAMC3Q9Y6N6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
LAMC3Q9Y6N6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC48.21■■■■■ 5.31
LAMC3Q9Y6N6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC48.17■■■■■ 5.3
LAMC3Q9Y6N6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
LAMC3Q9Y6N6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
LAMC3Q9Y6N6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC48.13■■■■■ 5.29
LAMC3Q9Y6N6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
LAMC3Q9Y6N6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
LAMC3Q9Y6N6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
LAMC3Q9Y6N6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
LAMC3Q9Y6N6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.05■■■■■ 5.28
LAMC3Q9Y6N6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC48.04■■■■■ 5.28
LAMC3Q9Y6N6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
LAMC3Q9Y6N6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC48.03■■■■■ 5.28
LAMC3Q9Y6N6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC48.02■■■■■ 5.28
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC48■■■■■ 5.28
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC48■■■■■ 5.28
LAMC3Q9Y6N6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC48■■■■■ 5.28
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC48■■■■■ 5.28
LAMC3Q9Y6N6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.99■■■■■ 5.27
LAMC3Q9Y6N6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
LAMC3Q9Y6N6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.97■■■■■ 5.27
LAMC3Q9Y6N6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC47.97■■■■■ 5.27
LAMC3Q9Y6N6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC47.97■■■■■ 5.27
LAMC3Q9Y6N6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC47.97■■■■■ 5.27
LAMC3Q9Y6N6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
LAMC3Q9Y6N6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC47.96■■■■■ 5.27
LAMC3Q9Y6N6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC47.96■■■■■ 5.27
LAMC3Q9Y6N6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
LAMC3Q9Y6N6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.27
LAMC3Q9Y6N6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.27
LAMC3Q9Y6N6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
LAMC3Q9Y6N6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
LAMC3Q9Y6N6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
LAMC3Q9Y6N6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
LAMC3Q9Y6N6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
LAMC3Q9Y6N6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.91■■■■■ 5.26
LAMC3Q9Y6N6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
LAMC3Q9Y6N6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC47.89■■■■■ 5.26
LAMC3Q9Y6N6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.25
LAMC3Q9Y6N6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
LAMC3Q9Y6N6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
LAMC3Q9Y6N6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC47.84■■■■■ 5.25
LAMC3Q9Y6N6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
LAMC3Q9Y6N6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
LAMC3Q9Y6N6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms