Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPTNQ9Y664 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPTNQ9Y664 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPTNQ9Y664 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPTNQ9Y664 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPTNQ9Y664 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KPTNQ9Y664 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KPTNQ9Y664 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KPTNQ9Y664 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KPTNQ9Y664 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KPTNQ9Y664 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPTNQ9Y664 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KPTNQ9Y664 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPTNQ9Y664 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPTNQ9Y664 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPTNQ9Y664 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPTNQ9Y664 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPTNQ9Y664 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPTNQ9Y664 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPTNQ9Y664 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPTNQ9Y664 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPTNQ9Y664 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPTNQ9Y664 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPTNQ9Y664 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPTNQ9Y664 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KPTNQ9Y664 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KPTNQ9Y664 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPTNQ9Y664 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPTNQ9Y664 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KPTNQ9Y664 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KPTNQ9Y664 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KPTNQ9Y664 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPTNQ9Y664 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPTNQ9Y664 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPTNQ9Y664 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPTNQ9Y664 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPTNQ9Y664 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPTNQ9Y664 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPTNQ9Y664 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPTNQ9Y664 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPTNQ9Y664 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KPTNQ9Y664 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KPTNQ9Y664 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms