Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y5

PEX16, Peroxisomal membrane protein PEX16, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX16Q9Y5Y5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX16Q9Y5Y5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX16Q9Y5Y5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX16Q9Y5Y5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX16Q9Y5Y5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PEX16Q9Y5Y5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX16Q9Y5Y5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX16Q9Y5Y5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX16Q9Y5Y5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX16Q9Y5Y5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX16Q9Y5Y5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX16Q9Y5Y5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX16Q9Y5Y5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX16Q9Y5Y5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PEX16Q9Y5Y5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX16Q9Y5Y5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX16Q9Y5Y5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX16Q9Y5Y5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX16Q9Y5Y5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX16Q9Y5Y5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX16Q9Y5Y5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX16Q9Y5Y5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX16Q9Y5Y5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX16Q9Y5Y5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX16Q9Y5Y5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX16Q9Y5Y5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX16Q9Y5Y5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX16Q9Y5Y5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX16Q9Y5Y5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX16Q9Y5Y5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX16Q9Y5Y5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX16Q9Y5Y5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX16Q9Y5Y5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX16Q9Y5Y5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX16Q9Y5Y5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX16Q9Y5Y5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX16Q9Y5Y5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PEX16Q9Y5Y5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX16Q9Y5Y5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX16Q9Y5Y5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX16Q9Y5Y5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX16Q9Y5Y5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX16Q9Y5Y5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX16Q9Y5Y5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX16Q9Y5Y5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX16Q9Y5Y5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX16Q9Y5Y5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX16Q9Y5Y5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX16Q9Y5Y5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX16Q9Y5Y5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX16Q9Y5Y5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PEX16Q9Y5Y5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PEX16Q9Y5Y5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX16Q9Y5Y5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX16Q9Y5Y5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX16Q9Y5Y5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX16Q9Y5Y5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX16Q9Y5Y5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX16Q9Y5Y5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX16Q9Y5Y5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX16Q9Y5Y5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX16Q9Y5Y5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX16Q9Y5Y5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX16Q9Y5Y5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX16Q9Y5Y5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms