Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCDHB2Q9Y5E7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCDHB2Q9Y5E7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCDHB2Q9Y5E7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCDHB2Q9Y5E7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCDHB2Q9Y5E7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCDHB2Q9Y5E7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCDHB2Q9Y5E7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCDHB2Q9Y5E7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCDHB2Q9Y5E7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCDHB2Q9Y5E7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PCDHB2Q9Y5E7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDHB2Q9Y5E7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDHB2Q9Y5E7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDHB2Q9Y5E7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDHB2Q9Y5E7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDHB2Q9Y5E7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCDHB2Q9Y5E7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCDHB2Q9Y5E7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PCDHB2Q9Y5E7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PCDHB2Q9Y5E7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCDHB2Q9Y5E7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCDHB2Q9Y5E7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCDHB2Q9Y5E7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCDHB2Q9Y5E7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCDHB2Q9Y5E7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PCDHB2Q9Y5E7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PCDHB2Q9Y5E7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PCDHB2Q9Y5E7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PCDHB2Q9Y5E7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PCDHB2Q9Y5E7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PCDHB2Q9Y5E7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PCDHB2Q9Y5E7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PCDHB2Q9Y5E7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PCDHB2Q9Y5E7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PCDHB2Q9Y5E7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PCDHB2Q9Y5E7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PCDHB2Q9Y5E7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PCDHB2Q9Y5E7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PCDHB2Q9Y5E7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PCDHB2Q9Y5E7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PCDHB2Q9Y5E7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PCDHB2Q9Y5E7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCDHB2Q9Y5E7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCDHB2Q9Y5E7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCDHB2Q9Y5E7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCDHB2Q9Y5E7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCDHB2Q9Y5E7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCDHB2Q9Y5E7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCDHB2Q9Y5E7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCDHB2Q9Y5E7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCDHB2Q9Y5E7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDHB2Q9Y5E7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDHB2Q9Y5E7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PCDHB2Q9Y5E7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PCDHB2Q9Y5E7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCDHB2Q9Y5E7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCDHB2Q9Y5E7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCDHB2Q9Y5E7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PCDHB2Q9Y5E7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PCDHB2Q9Y5E7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PCDHB2Q9Y5E7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PCDHB2Q9Y5E7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PCDHB2Q9Y5E7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PCDHB2Q9Y5E7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PCDHB2Q9Y5E7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PCDHB2Q9Y5E7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PCDHB2Q9Y5E7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCDHB2Q9Y5E7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCDHB2Q9Y5E7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCDHB2Q9Y5E7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCDHB2Q9Y5E7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCDHB2Q9Y5E7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCDHB2Q9Y5E7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PCDHB2Q9Y5E7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCDHB2Q9Y5E7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCDHB2Q9Y5E7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCDHB2Q9Y5E7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCDHB2Q9Y5E7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCDHB2Q9Y5E7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCDHB2Q9Y5E7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCDHB2Q9Y5E7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDHB2Q9Y5E7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDHB2Q9Y5E7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDHB2Q9Y5E7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDHB2Q9Y5E7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDHB2Q9Y5E7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDHB2Q9Y5E7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PCDHB2Q9Y5E7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCDHB2Q9Y5E7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCDHB2Q9Y5E7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCDHB2Q9Y5E7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCDHB2Q9Y5E7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCDHB2Q9Y5E7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms