Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EMC9Q9Y3B6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMC9Q9Y3B6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMC9Q9Y3B6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMC9Q9Y3B6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMC9Q9Y3B6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EMC9Q9Y3B6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMC9Q9Y3B6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EMC9Q9Y3B6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMC9Q9Y3B6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMC9Q9Y3B6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMC9Q9Y3B6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMC9Q9Y3B6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMC9Q9Y3B6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMC9Q9Y3B6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMC9Q9Y3B6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMC9Q9Y3B6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMC9Q9Y3B6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMC9Q9Y3B6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EMC9Q9Y3B6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMC9Q9Y3B6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMC9Q9Y3B6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMC9Q9Y3B6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMC9Q9Y3B6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMC9Q9Y3B6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMC9Q9Y3B6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMC9Q9Y3B6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMC9Q9Y3B6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMC9Q9Y3B6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMC9Q9Y3B6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMC9Q9Y3B6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMC9Q9Y3B6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EMC9Q9Y3B6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMC9Q9Y3B6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMC9Q9Y3B6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMC9Q9Y3B6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMC9Q9Y3B6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMC9Q9Y3B6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMC9Q9Y3B6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMC9Q9Y3B6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EMC9Q9Y3B6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EMC9Q9Y3B6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMC9Q9Y3B6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EMC9Q9Y3B6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMC9Q9Y3B6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMC9Q9Y3B6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMC9Q9Y3B6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMC9Q9Y3B6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMC9Q9Y3B6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMC9Q9Y3B6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMC9Q9Y3B6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMC9Q9Y3B6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMC9Q9Y3B6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC9Q9Y3B6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMC9Q9Y3B6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMC9Q9Y3B6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMC9Q9Y3B6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMC9Q9Y3B6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMC9Q9Y3B6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMC9Q9Y3B6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMC9Q9Y3B6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EMC9Q9Y3B6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMC9Q9Y3B6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMC9Q9Y3B6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMC9Q9Y3B6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EMC9Q9Y3B6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EMC9Q9Y3B6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EMC9Q9Y3B6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMC9Q9Y3B6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMC9Q9Y3B6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMC9Q9Y3B6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMC9Q9Y3B6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMC9Q9Y3B6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
EMC9Q9Y3B6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMC9Q9Y3B6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMC9Q9Y3B6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMC9Q9Y3B6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EMC9Q9Y3B6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMC9Q9Y3B6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMC9Q9Y3B6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms