Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPR55Q9Y2T6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPR55Q9Y2T6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR55Q9Y2T6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR55Q9Y2T6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR55Q9Y2T6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR55Q9Y2T6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR55Q9Y2T6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR55Q9Y2T6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR55Q9Y2T6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPR55Q9Y2T6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPR55Q9Y2T6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPR55Q9Y2T6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPR55Q9Y2T6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPR55Q9Y2T6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPR55Q9Y2T6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPR55Q9Y2T6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPR55Q9Y2T6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPR55Q9Y2T6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPR55Q9Y2T6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPR55Q9Y2T6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPR55Q9Y2T6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPR55Q9Y2T6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPR55Q9Y2T6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPR55Q9Y2T6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPR55Q9Y2T6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPR55Q9Y2T6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPR55Q9Y2T6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPR55Q9Y2T6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPR55Q9Y2T6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GPR55Q9Y2T6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPR55Q9Y2T6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR55Q9Y2T6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR55Q9Y2T6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR55Q9Y2T6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR55Q9Y2T6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR55Q9Y2T6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR55Q9Y2T6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR55Q9Y2T6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR55Q9Y2T6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPR55Q9Y2T6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPR55Q9Y2T6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPR55Q9Y2T6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPR55Q9Y2T6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPR55Q9Y2T6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPR55Q9Y2T6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR55Q9Y2T6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR55Q9Y2T6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR55Q9Y2T6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPR55Q9Y2T6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPR55Q9Y2T6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPR55Q9Y2T6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPR55Q9Y2T6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPR55Q9Y2T6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR55Q9Y2T6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR55Q9Y2T6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPR55Q9Y2T6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPR55Q9Y2T6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPR55Q9Y2T6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPR55Q9Y2T6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPR55Q9Y2T6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPR55Q9Y2T6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPR55Q9Y2T6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPR55Q9Y2T6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GPR55Q9Y2T6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPR55Q9Y2T6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPR55Q9Y2T6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPR55Q9Y2T6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPR55Q9Y2T6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPR55Q9Y2T6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPR55Q9Y2T6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPR55Q9Y2T6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GPR55Q9Y2T6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPR55Q9Y2T6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPR55Q9Y2T6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPR55Q9Y2T6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPR55Q9Y2T6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPR55Q9Y2T6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPR55Q9Y2T6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPR55Q9Y2T6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPR55Q9Y2T6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPR55Q9Y2T6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPR55Q9Y2T6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPR55Q9Y2T6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPR55Q9Y2T6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPR55Q9Y2T6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPR55Q9Y2T6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPR55Q9Y2T6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPR55Q9Y2T6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPR55Q9Y2T6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPR55Q9Y2T6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GPR55Q9Y2T6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPR55Q9Y2T6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPR55Q9Y2T6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GPR55Q9Y2T6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPR55Q9Y2T6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPR55Q9Y2T6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPR55Q9Y2T6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPR55Q9Y2T6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPR55Q9Y2T6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms