Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL20Q9Y2M5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL20Q9Y2M5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL20Q9Y2M5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL20Q9Y2M5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL20Q9Y2M5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL20Q9Y2M5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL20Q9Y2M5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL20Q9Y2M5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL20Q9Y2M5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL20Q9Y2M5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL20Q9Y2M5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL20Q9Y2M5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL20Q9Y2M5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL20Q9Y2M5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL20Q9Y2M5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL20Q9Y2M5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL20Q9Y2M5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL20Q9Y2M5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL20Q9Y2M5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL20Q9Y2M5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL20Q9Y2M5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL20Q9Y2M5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL20Q9Y2M5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL20Q9Y2M5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL20Q9Y2M5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL20Q9Y2M5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL20Q9Y2M5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL20Q9Y2M5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL20Q9Y2M5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL20Q9Y2M5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL20Q9Y2M5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL20Q9Y2M5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL20Q9Y2M5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL20Q9Y2M5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL20Q9Y2M5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL20Q9Y2M5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL20Q9Y2M5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL20Q9Y2M5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL20Q9Y2M5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL20Q9Y2M5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL20Q9Y2M5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL20Q9Y2M5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL20Q9Y2M5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL20Q9Y2M5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL20Q9Y2M5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL20Q9Y2M5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL20Q9Y2M5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL20Q9Y2M5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL20Q9Y2M5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL20Q9Y2M5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL20Q9Y2M5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL20Q9Y2M5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL20Q9Y2M5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL20Q9Y2M5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL20Q9Y2M5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL20Q9Y2M5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL20Q9Y2M5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms